Après réflexion, je me dis qu'il serait intéressant d'ajouter la fonction de repair de flyway pour réparer les problèmes de checksum sur une base de données. Car même avec la meilleure volonté du monde, nous avons encore ce type d'erreur lorsque le projet tire un moment un artifact avec les scripts packagés avec la licence.
On pourrait ajouter cet appel au moment du chargement des extensions juste avant l'appel de la migration. Cette fonctionnalité serait à activer via propriété.