Quand on supprime une carte, elle est bien supprimée, mais juste après on en crée une nouvelle.
Tout se joue dans LayoutFichePlugin.traiterPrincipal, quand on appel retrieveModelFromDatas, on passe un booléen en paramètre. Celui-ci a une valeur qui peut être biaisée car on compare deux "Long" avec un "=" :

final boolean resetModelIds = ficheUniv.getIdFiche() != idFiche;

Il faudra penser à faire un script de nettoyage car ce souci a créé un grand nombre de clone des card.